O curso de Farmácia da FMABC oferece um currículo amplo, preocupado desde o início com a formação de profissionais capacitados e conscientes de sua atuação como profissional de saúde, nos assuntos relativos às Ciências Farmacêuticas, preparando-os para atuar em drogarias, farmácias, hospitais, indústrias farmacêuticas, indústrias cosméticas, indústrias de alimentos, laboratórios de análises clínicas e toxicológicas, além de diversas áreas onde o profissional Farmacêutico está habilitado a atuar.
Um diferencial do curso de Farmácia da FMABC são os estágios em consulta farmacêutica nos ambulatórios de especialidades da FMABC em que o aluno acompanha as orientações farmacêuticas aos pacientes atendidos sobre o uso correto de medicamentos. Os alunos contam ainda com estágios na farmácia universitária e em farmácia clínica e hospitalar no Hospital Ensino Mario Covas.
A FMABC oferece uma estrutura de ensino privilegiada, os professores, mestres e doutores, têm grande experiência em suas áreas de atuação e garantem o ensino de qualidade. Contando com vários laboratórios, ambulatórios de especialidades, bem como um agradável ambiente de convivência social construído e conquistado por todos os alunos.